Para realização de suas ações o Instituto Argonauta conta com a parceria formal do Aquário de Ubatuba, Prefeitura Municipal de Ubatuba e Prefeitura Municipal de São Sebastião, além do apoio de diversas instituições do primeiro, segundo e terceiro setor como: IBAMA, ICMBio, Fundação Florestal, Prefeitura Municipal de Ilhabela, Embalixo, Ekomat Yoga, Tamoio de Ubatuba, Projeto Tamar, Cooperativa Educacional de Ubatuba, escolas e universidades públicas e privadas, entre outras.
A colaboração desses parceiros fortalece a capacidade do Instituto de proteger os oceanos e a vida marinha, transformando desafios em oportunidades e construindo um futuro marinho mais saudável e sustentável para as gerações presentes e futuras.
